Pelagibacter ubique
Pelagibacter ubique est une petite alphaproteobacteria hétérotrophe, trouvée dans l'ensemble des océans. C'est peut-être la bactérie la plus représentée au monde.
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- ). La dernière étape consiste à essayer de cultiver... Pelagibacter ubique, modèle de bactérie oligotrophe stricte. Pelagibacter ubique a été isolée... (source : biologie-journal)
Pelagibacter ubique est une petite alphaproteobacteria hétérotrophe, trouvée dans l'ensemble des océans. C'est peut-être la bactérie la plus représentée au monde (peut-être 1028 cellules). Cette bactérie était à l'origine appelée SAR11 et connue uniquement grâce à ses ARNr identifiés dans des échantillons de la mer des Sargasses en 1990. La bactérie a ensuite été isolée et décrite en 2002.
Composant du bactérioplancton, Pelagibacter a une distribution mondiale. Particulièrement petite, elle a une longueur de 0, 37-0, 89 µm et un diamètre d'uniquement 0, 12-0, 20 µm.
Tout petit, le génome de Pelagibacter est séquencé : il contient 1, 3 Mpb et 1 354 gènes. Il n'y a pas d'introns, pas de transposons, pas de pseudogènes, pas d'éléments extragéniques, pas d'intéines et peu de paralogues.
Références
- Michæl S. Rappé, Stephanie A. Connon, Kevin L. Vergin, Stephen J. Giovannoni (2002). "Cultivation of the ubiquitous SAR11 marine bacterioplankton clade". Nature 418 : 630-633.
- R. M. Morris et al. (2002). "SAR11 clade dominates ocean surface bacterioplankton communities". Nature 420 : 806 - 810.
- Stephen J. Giovannoni, H. James Tripp et . al (2005). "Genome Streamlining in a Cosmopolitan Oceanic Bacterium". Science 309 : 1242-1245.
- Référence NCBI : Candidatus Pelagibacter (en)
- Référence NCBI : Candidatus Pelagibacter ubique Rappe et al. 2002 (en)
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